项目是什么，文件放哪
图文 + 结构示意图 ｜ 面向零技术背景的学术用户 ｜ 看懂"项目文件夹"和侧栏的对应关系
第一次用 Scholardo，它会让你"新建一个项目、选个文件夹"。很多人第一反应是：项目到底是什么？我的 PDF、笔记、草稿放哪？这一篇把它讲清楚。
Welcome 欢迎页里已经有一句话点题（英文原文，A7）： "A project is a folder for one paper or topic. Your sources, notes, and AI chats all live inside it." （一个项目就是"一篇论文或一个主题"的文件夹，你的文献、笔记、AI 对话都住在里面。）
一句话：项目 = 一篇论文的家
一个 Scholardo 项目就是你磁盘上的一个普通文件夹。你的文献 PDF、笔记、草稿、和 AI 的对话记录，全都装在这一个文件夹里。想备份就整个拷走，想换台电脑就整个搬走——它不是藏在某个数据库里，就是你能在访达里看到的文件夹。
侧栏 4 个 tab ↔ 文件夹的对应
Scholardo 左侧有 4 个主 tab，每个 tab 就对应项目文件夹里的一个真实子目录：
| 侧栏 tab | 对应文件夹 | 放什么 |
|---|---|---|
| Sources | sources/ | 你的输入材料：文献 PDF、参考文献、订阅源 |
| Notebook | notebook/ | 你的笔记与待办 |
| Outputs | outputs/ | 你的产出：草稿、导出等 |
| Agent | agent/ | AI 的记忆、规则、技能等配置 |
📌 这 4 个 tab 名称目前显示为英文（Sources / Notebook / Outputs / Agent），即使系统语言是中文也是英文——上表括注了中文含义帮助理解。
Sources 里还分三类
点开 Sources，内容区还有三个子分类：
- Docs →
sources/docs/：你的文献 PDF 放这里（拖进来或用"Save to Sources/Docs"）。 - Refs →
sources/refs/：参考文献 / BibTeX 条目。 - Feeds →
sources/feeds/：RSS 订阅源。
💡 所以之前教程里说"把 PDF 放进 sources"，更准确地说是放进 Sources › Docs（
sources/docs/）。你在 Sources 界面拖入 PDF，Scholardo 会自动归到 Docs。
文件夹结构长这样（访达视角）
在访达里打开你的项目文件夹，大致是这样（简化）：
我的论文/
├── project.yml ← 项目配置
├── sources/ ← 【Sources tab】输入材料
│ ├── docs/ ← 文献 PDF 放这里
│ ├── refs/ ← 参考文献 / BibTeX
│ └── feeds/ ← RSS 订阅
├── notebook/ ← 【Notebook tab】
│ ├── notes/ ← 笔记
│ └── todo/ ← 待办
├── outputs/ ← 【Outputs tab】草稿 / 导出
├── agent/ ← 【Agent tab】AI 记忆 / 规则 / 技能
└── .scholardo/ ← 程序内部数据（一般不用管）
├── scholardo.db ← 本项目索引库
├── file-groups.json ← 文件分组
└── reading-status.json ← 阅读进度
.scholardo/是隐藏目录，存放 Scholardo 自己用的索引和状态，你平时不需要动它。
隐私边界：AI 只看得到这个项目文件夹
一个重要的安全保证：在 Scholardo 里，AI 只能读写你当前项目文件夹以内的文件，碰不到文件夹以外的东西。这不是靠"提醒 AI 别乱看"，而是程序在底层硬性拦截了任何越界访问——AI 试图读写项目根目录以外的路径会被直接拒绝（报错类似 Path is outside the project root）。
换句话说：你放进这个项目的，才是 AI 看得到的；你桌面上、其他文件夹里的东西，AI 够不着。 想让 AI 参考某份材料，就把它放进对应的 tab / 文件夹。
Shot list（配图清单）
Scholardo 界面用当前发布版录制。示意图用简化结构，避免展示真实研究材料。
| 素材 | 内容 | 界面来源 | 关键 callout |
|---|---|---|---|
| 图 1 | 结构示意图：项目文件夹 → 4 个子目录 ↔ 4 个侧栏 tab 的连线映射 | 自制示意图 | 每条连线标注 tab 名（英文）+ 中文含义 |
| 图 2 | Scholardo 侧栏 4 个 tab（Sources / Notebook / Outputs / Agent） | Scholardo | 圈出 4 个 tab 图标与名称 |
| 图 3 | Sources 内容区的 Docs / Refs / Feeds 子分类，Docs 里有几篇 PDF | Scholardo | 圈出"PDF 归在 Docs" |
| 图 4 | 访达里打开项目文件夹，与上文结构树对照 | 访达 | 圈出 sources/docs、notebook、outputs |
| 图 5 | 隐私边界示意：项目文件夹内=AI 可见；文件夹外=AI 够不着 | 自制示意图 | "AI 只看得到这个文件夹" |
关键 callout 汇总
- 项目 = 一个普通文件夹：能在访达里看到、整体备份/搬移。
- 4 tab ↔ 4 目录：Sources/Notebook/Outputs/Agent 各对应一个子目录（名称目前为英文）。
- PDF 放 Sources › Docs（
sources/docs/）。 - AI 只看得到这个项目文件夹：越界访问被程序硬性拦截。
数据隐私披露
当你让 AI 阅读、总结、润色项目里的文稿时，这些内容会发送给所选 AI 服务商处理。需要说明两点边界：其一，AI 只能访问当前项目文件夹以内的文件（越界被程序拦截）；其二，一旦你主动发起对话、让它读某份材料，该材料内容就会经网络传给所选服务商（Anthropic / OpenAI / DeepSeek 等），由其按隐私政策处理。若材料涉及未公开数据、受访者隐私或保密协议，请先确认发送给第三方 AI 服务是否符合你所在机构的合规要求。