Outputs → Writing：写作

Outputs 存放你要交出去的东西。Writing 分区是其中的手稿部分——论文、报告、章节草稿。

新建

底部 New 菜单：

• Draft——新建一篇普通手稿
• Slide——新建一份幻灯片（见 Figures / Tables / Exports）

也可以 Import… 或直接把文件拖进列表。

多章手稿

一篇长论文可以拆成多个章节文件，Scholardo 把它们识别为一个手稿组，在列表里显示为一个整体（「N chapters」）。

手稿组的右键菜单：

• Rename manuscript…——重命名整个手稿（所有章节文件一起改）
• Export entire manuscript…——把所有章节按顺序合并导出

编辑手稿

手稿用 Markdown 编辑器打开，编辑 / 阅读双模式。工具栏与 Notes 一致，另加：

• Undo / Redo
• Auto-format markdown——一键规范化格式
• Clean hidden characters——清除粘贴带进来的零宽字符、不间断空格等隐藏字符（从 PDF 或网页复制文字时常见）

插入引用

在阅读模式下选中一段文字，浮动工具栏里有 Find citations——让 AI 为这段论述找支撑文献，从你的 Refs 库里挑，并把引用插入正文。

引用按你在 Refs 里选定的 CSL 样式渲染。详见 引用管理。

写作意图（Writing Context）

每篇手稿可以带一份写作意图说明：这篇是写给谁的、什么期刊、什么语气、什么长度限制。

这份说明打通了两条 AI 路径：

• Agent 侧——通过 MCP 工具 get_writing_context / set_writing_context 读写
• API 侧——选区润色、校对时自动注入，让 AI 知道你在写什么

所以你只要说明一次「这是投 Nature Communications 的引言，要克制、不要 hype」，之后所有的润色请求都会遵守这个约束。

Markdown 里能画什么

阅读模式的渲染器支持一批学术写作常用的围栏块：

围栏	渲染成
```mermaid	流程图、时序图、甘特图
```markmap	思维导图（从嵌套列表生成）
```chart	数据图表
```smiles	化学结构式
```abc	乐谱
```pseudocode	算法伪代码
$...$ / $$...$$	LaTeX 公式

还支持学术编号（图 1、表 2 自动编号与交叉引用）。

这些都是离线渲染

所有渲染引擎都打包在应用内，不联网、不上传。你的手稿内容不会因为画一张图而离开本机。

外部修改的处理

如果一个文件在编辑器打开期间被外部改动（agent 写入、git 切分支、另一台设备同步），Scholardo 会提示你选择：

• Keep mine——保留你编辑器里的版本
• Use the new one (discard mine)——采用磁盘上的新版本

不会静默覆盖任何一方。

agent 正在写的时候

Agent 活跃期间，编辑器会暂缓自动保存，避免你的自动保存和 agent 的写入互相打架被误报成「文件被外部修改」。